EPPEO tem como objetivo principal investigar como as formas de controle social e as relações de poder intervêm nos processos e relações de trabalho, na gestão e nas articulações político-estratégicas das organizações, sejam estas unidades produtivas sob o comando do capital, sejam estas coletivistas de trabalho, sejam estas públicas, sociais ou solidárias, definindo as possibilidades da construção de relações de trabalho emancipatórias.
Seus objetivos específicos são oferecer material de pesquisa para a elaboração de dissertações e teses; produzir relatórios de pesquisa para apresentações em congressos nacionais e internacionais; produzir material didático impresso e digital sobre a temática; divulgar informações estatísticas e mapas sobre a temática de maneira a contribuir com o aprofundamento das pesquisas e dos estudos na área das organizações.